總務課
負責執行各項人事、庶務、出納、管理課、殘毒檢驗等。
主計課
負貢執行各項會計，審核。
管理課
負責執行各項交通管理，水電消防設備，現場設備管理，取締外來傾倒垃圾者。
業務課
負責行情報導，品管、企劃、服務、收取管理貴等。
殘毒檢驗
為維護農民權益與消費者健康，本公司設置之蔬果農藥殘留檢驗站特別墻加檢驗設備與人員蔬菜檢驗，鼓勵農民在採收以前，將蔬菜取樣送至檢驗站檢驗，如檢驗結果超過農藥殘留標準，即通知農民暫緩採收。
已進入市場的蔬菜，本公司派員現場抽驗，檢驗不合格者，依據西螺農產品市場股份有限公司進場果菜農藥殘留檢驗處理要點處置，通知貨主暫緩銷售，送驗程序每日上午九時以前將橡品送達檢驗站，三小時內即可知道檢驗結果。對於農民送驗完全免費。
營利單位；如供應學校午餐、超市、工廠、醫院、或其他營利事業單位。可要求檢驗站開具檢驗報告單，每件樣品收取檢驗費新台幣五十元整。
本公司對於消費者食的安全做最好的把關。